LEGO DC Villains tiene lugar en un mundo donde la Liga de la Justicia ha desaparecido, dejando a un grupo de superhéroes de un universo paralelo para hacerse cargo de proteger al planeta del mal como el "Sindicato de la Justicia". El equipo de supervillano más famoso de DC, Legion of Doom, descubre que el Sindicato de la Justicia no es lo que parecen ser. Dependerá de la Legión de la Perdición detener los malvados planes del Sindicato de Justicia.